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IPLをSKへ変換する方法

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フォーマットについて

IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
開発元: Scanalytics
初回リリース: 1988
SKは、1998年10月31日に最初の公開リリースが行われた、Bernhard Herzogによって作成されたLinux用の無料ベクターグラフィックスエディタSkencil(旧称Sketch)のネイティブファイル形式です。SkencilはほぼPython全体で書かれた最初期のフル機能ベクター描画アプリケーションの1つとして歴史的な重要性を持ち、パフォーマンスが重要なレンダリングコンポーネントのみがCで実装されています。SKファイル形式はPythonに類似したテキストベースの構文でドキュメント構造を記述し、ページ、レイヤー、グループ、個々のグラフィックオブジェクトは座標、色、線種、変換を指定するパラメータ付きのネストされたステートメントとして表現されます。この形式は、ベジェ曲線、矩形、楕円、フォント指定付きテキストオブジェクト、インポートされたラスター画像、グラデーションおよびパターン塗りつぶし、アフィン変換付き階層グループをサポートしています。1つの利点は人間可読性です — SKファイルは任意のテキストエディタで開くことができ、シンプルなスクリプトを使用してアートワークをプログラムで検査、変更、生成することが可能です。Pythonネイティブの構造も自動化のメリットを提供します。Skencil自体がPythonアプリケーションであるため、ファイル形式はバッチ処理や手続き的グラフィック生成のスクリプトワークフローと自然に統合されます。Skencilの開発は2000年代半ば以降に減速しましたが、そのSK形式はsK1プロジェクトの基盤となり、形式を拡張してオープンソースベクターグラフィックス開発を継続しました。SKファイルはsK1、UniConvertor、その他のオープンソースツールを通じて変換可能です。
開発元: Bernhard Herzog
初回リリース: 1998年10月31日