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フォーマットについて
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
TIFF（Tagged Image File Format）は、1986年10月にデスクトップパブリッシングおよびスキャニングアプリケーション向けにAldus Corporation（後にAdobeが買収）が開発した柔軟なラスター画像フォーマットです。このフォーマットはタグ付きデータ構造を使用し、画像ファイルヘッダーが1つ以上のImage File Directory（IFD）を指し、各IFDには画像の寸法、色空間、圧縮方式、解像度、その他のプロパティを記述するタグのセットが含まれています。この拡張可能なアーキテクチャにより、TIFFは事実上あらゆる画像タイプに対応できます。1ビットの2値画像、グレースケール、インデックスカラー、RGB、CMYK、CIE L*a*b*など、サンプルあたり1〜64ビットの任意のビット深度が利用可能です。TIFFは複数の圧縮方式をサポートしており、非圧縮、LZW、DEFLATE、JPEG、CCITT Group 3/4ファクス圧縮が含まれます。また、複数ページドキュメント、大きな画像への効率的なランダムアクセスのためのタイル格納、HDRコンテンツ用の浮動小数点ピクセル値にも対応しています。利点の一つはプロフェッショナルグレードの柔軟性です — TIFFは出版、プリプレス、医用画像、地理空間分析、科学研究で必要とされる特殊な色空間と高ビット深度を含む、あらゆる種類の画像を処理できます。ロスレスのアーカイブ品質もまた核心的な強みです。非圧縮またはLZW/DEFLATE圧縮のTIFFはすべてのピクセル値を正確に保持し、長期的な画像の忠実性が保証される必要のある図書館、博物館、その他のあらゆる機関の標準アーカイブフォーマットとなっています。TIFFはすべてのプラットフォームの主要な画像編集、スキャニング、パブリッシングアプリケーションでサポートされています。