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IPLをJBIGへ変換する方法

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フォーマットについて

IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
開発元: Scanalytics
初回リリース: 1988
JBIG(Joint Bi-level Image experts Group)は、1993年に公開されたロスレス画像圧縮規格(ITU-T T.82)で、JPEGを開発したのと同じ国際標準化団体の専門家委員会によって策定されました。.jbigと.jbg拡張子は同じ基礎的な圧縮規格を指しますが、.jbigは生のJBIG圧縮データストリームを扱うソフトウェアで一般的に使用されるより明示的な形式です。圧縮アルゴリズムはコンテキスト依存算術符号化を中心としています。各ピクセルをエンコードする前に、エンコーダは現在の行と前の行から10〜16個の近傍ピクセルの設定可能なテンプレートを検査してコンテキスト — 数千の可能なローカルピクセル配置の一つ — を決定します。各コンテキストはエンコーディングの進行に伴って継続的に更新される独自の適応確率推定を維持し、コーダーが各画像領域に固有の統計パターンを利用できるようにします。このアプローチにより、テキスト、線画、網点写真、混合コンテンツページを単一のアルゴリズムで処理でき、Group 3の固定ハフマンテーブルやGroup 4のシンプルな予測モデルよりも一貫して優れた圧縮を達成します。後の改訂であるJBIG2(T.88)は、さらに高い圧縮のためにパターンマッチングおよびロッシーモードを追加しましたが、オリジナルのJBIGは今なお広く展開されています。JBIGの利点の一つはアルゴリズムの適応性です。固定統計モデルを使用するGroup 3/4コーデックとは異なり、JBIGはエンコード中に各特定画像の特性を継続的に学習し、大きく異なるコンテンツタイプにわたってほぼ最適な圧縮を提供します。この規格は多くの複合機やドキュメントスキャナーの内部画像処理に組み込まれています。JBIGファイルはImageMagick、jbigkit、企業文書イメージングシステムで処理可能です。
初回リリース: 1993