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フォーマットについて
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
PCX（PiCture eXchange）は、1985年にZSoft CorporationがIBM PC互換機向けの初期のペイントプログラムの一つであるPC Paintbrushアプリケーションのネイティブフォーマットとして作成したラスター画像フォーマットです。このフォーマットはシンプルなランレングス符号化（RLE）圧縮方式を使用し、連続する同一ピクセル値をカウント-値ペアに置き換えることで、均一な色の大きな領域を持つ画像で適度な圧縮を実現します。PCXファイルは、128バイトのヘッダー（寸法、色深度、パレット情報、DPI、エンコード方式を指定）、スキャンライン順序で構成されたRLE圧縮ピクセルデータ、および画像データの後に追加されるオプションの256色パレットで構成されています。このフォーマットはいくつかのバージョンを経て進化し、増加する色深度に対応しました。1ビットモノクロ、4ビット（16色）、8ビット（256色）、そして複数のカラープレーンを使用した24ビットトゥルーカラーです。PCXはDOS時代に最も普及した画像フォーマットの一つとなり、1980年代後半から1990年代初頭にかけてペイントプログラム、ワープロ、デスクトップパブリッシング、初期のゲームで広くサポートされました。利点の一つはDOS時代の幅広いソフトウェア互換性でした — 競合するプログラムが独自のラスターフォーマットを使用していた時代に、PCXは実用的な交換フォーマットとして機能しました。RLEデコーディングのシンプルさもまた強みで、当時のハードウェアに最適な最小限のCPUとメモリリソースしか必要としませんでした。PNG、JPEG、その他の現代的なフォーマットが現代の用途においてPCXに取って代わりましたが、このフォーマットはレガシーアーカイブやレトロコンピューティングのコンテキストで依然として見られます。