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フォーマットについて
IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
PDF(Portable Document Format、ポータブルドキュメント形式)は、John WarnockとCharles Geschkeが共同設立したAdobe Systemsによって開発され、1993年6月15日に最初のバージョンがリリースされました。簡略化されたPostScriptイメージングモデルに基づき、PDFはテキストとフォント、ベクターグラフィックス、ラスター画像、インタラクティブ要素を含む完全なドキュメント記述を、あらゆるプラットフォーム、デバイス、プリンターで同一にレンダリングされる自己完結型ファイルにカプセル化します。この形式は複数のバージョンを経て進化し、2008年に国際標準ISO 32000-1(PDF 1.7)、2017年にISO 32000-2(PDF 2.0)として採用され、長期的なベンダー独立性を保証しています。PDFはデジタル署名、フォームフィールド、注釈、ブックマーク、アクセシビリティタグ、暗号化、JavaScript、マルチメディア埋め込み、3Dコンテンツ、アーカイブ固有のプロファイル(PDF/A)など、極めて広範な機能をサポートしています。絶対的な視覚忠実性が一つの利点です — PDFドキュメントはWindows、macOS、Linux、iOS、Androidのいずれで開いても、どのプリンターで印刷しても、作成から何十年後に閲覧しても、まったく同じに見えます。普遍的なソフトウェアサポートがはもう一つの核心的強みです:PDFビューアはすべての主要オペレーティングシステムとウェブブラウザに組み込まれており、世界中の数百のアプリケーションで読み取ることができます。PDF/A(アーカイブ)、PDF/X(印刷制作)、PDF/UA(アクセシビリティ)などの専門的なISOプロファイルは、規制のある業界へとこの形式の適用範囲を拡大しています。PDFはビジネス、政府、法律、学術、出版の各分野におけるドキュメント交換のグローバル標準となっています。