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フォーマットについて
IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
RAS(Sun Raster)は、Sun MicrosystemsがSunOSおよびSolaris Unixワークステーション向けに開発したラスター画像フォーマットで、およそ1982年頃に登場しました。Sun Rasterファイルは1ビットモノクロ、8ビットインデックスカラー(カラーマップ付き)、24ビットトゥルーカラー(BGRバイト順)、32ビットXBGR(未使用のアルファバイト付き)をサポートする2Dビットマップ画像を格納します。フォーマットはマジックナンバー(0x59a66a95)、幅、高さ、ビット深度、データ長、ラスタータイプ(圧縮を示す)、カラーマップタイプ、カラーマップ長を含む32バイトのヘッダーを使用し、オプションのカラーマップデータとピクセルデータが続きます。RASは3つのエンコーディングモードをサポートします。標準(各スキャンラインが16ビット境界にパディングされた非圧縮)、バイトエンコード(シンプルなエスケープコードスキームを使用したランレングスエンコード)、RGB(BGRではなくRGBバイト順の非圧縮)です。Sun RasterはSunのウィンドウシステム、後のOpenWindowsデスクトップ環境のネイティブ画像フォーマットであり、1980年代から1990年代を通じてSunワークステーションのスクリーンショット、アイコン、背景、アプリケーショングラフィックスの標準フォーマットとして機能しました。RASの利点の一つは、Unixワークステーションコンピューティングの遺産の記録としての役割です。SunOS/Solaris時代のSun Rasterファイルは、ネットワーキング、マルチプロセッシング、グラフィックスワークステーション設計の進歩を推進した重要なコンピューティングプラットフォームの視覚文化を記録しています。フォーマットの単純な構造もまた実用的な強みです — 32バイトヘッダーとシンプルなエンコーディングにより、カスタムコードでもRASファイルを容易に解析・変換できます。RASファイルはImageMagick、GIMP、XnView、およびその他の画像処理ツールでサポートされています。