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フォーマットについて
IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
G4は、ITU-T Group 4ファクシミリ符号化規格(勧告T.6)に基づくモノクロ画像フォーマットで、1984年にCCITTによってアナログ電話回線ではなくISDNのようなエラーフリーのデジタルネットワークでの使用を目的としたGroup 3の改良版として批准されました。G4ファイルは、排他的に2次元Modified Modified READ(MMR)符号化を使用して圧縮された1ビット画像データを含みます。各スキャンラインは、その上の行に対する差分(変化要素)のセットとしてエンコードされます。1次元符号化のフォールバックとGroup 3で必要とされた行末同期マーカーを排除することにより、G4は典型的な文書ページで20〜50%優れた圧縮率を達成し、よりシンプルで規則的なビットストリームを生成します。このフォーマットは、TIFFファイル内の圧縮方式(TIFF圧縮タグ4)として最も一般的に遭遇し、企業文書管理、政府記録、法的イメージングシステムにおけるスキャン文書の標準アーカイブフォーマットとなりました。G4圧縮はスキャンアプリケーションに応じて200、300、または400 dpiで指定され、アーカイブ品質の文書イメージングでは300 dpiが最も一般的です。G4の利点の一つは、文書コンテンツに対する卓越した圧縮効率です。G4の2次元予測はテキストおよび線画ページの強い垂直相関を利用し、300 dpiのレターサイズページを通常30〜50KB — 同等のGroup 3エンコーディングのおよそ半分のサイズ — に圧縮します。文書管理インフラへの深い浸透もまた強みです — G4 TIFFは多くの政府デジタルレコードシステム、裁判所書類提出システム、企業アーカイブの指定フォーマットであり、すべての企業イメージングプラットフォームでサポートされています。