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フォーマットについて
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
FIGは、1985年にテキサス大学オースティン校のSupoj Sutanthavibulによって作成されたX Window System用の無料ベクターグラフィックスエディタXfigのネイティブファイル形式です。この形式は、各グラフィックオブジェクトを1行以上の数値パラメータで記述するテキストベースの構造を使用し、オブジェクトタイプ、座標、線プロパティ、塗りつぶし属性、深度順序を指定します。FIGは複合オブジェクト（グループ）、ポリライン、ポリゴン、スプライン、円弧、楕円、フォント指定付きテキスト文字列、インポートされたラスター画像をサポートし、それぞれに設定可能な色、線種、矢印ヘッド、エリア塗りつぶしがあります。ファイルはフォーマットバージョン（現在3.2）を宣言するヘッダー行から始まり、解像度仕様とオブジェクト定義が続きます。1つの利点は卓越したシンプルさです — 完全にテキストベースの形式はスクリプトで簡単に解析、生成、操作でき、FIGは自動ダイアグラム生成パイプラインの中間形式として人気があります。豊富な変換ツールエコシステムはもう1つの強みです。fig2devはFIGファイルをEPS、PDF、SVG、LaTeX picture環境、PSTricks、TikZなど数十の出力形式にエクスポートします。これにより、XfigとFIGは学術・科学コミュニティで特に人気を博し、LaTeXドキュメントとシームレスに統合される出版品質の図版を作成できました。1980年代以降グラフィカルツールは進化しましたが、FIGはスクリプト性、LaTeX統合、十分に文書化されたフォーマットの安定性を評価する研究者の間で引き続き使用されています。