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Über die Formate
RLE (Run-Length Encoded) bezeichnet im Kontext des Utah RLE-Formats ein Rasterbildformat, das um 1983 von Spencer W. Thomas am Informatik-Fachbereich der University of Utah als Teil des Utah Raster Toolkit entwickelt wurde. Das Format speichert Bilder mit einem scanline-orientierten Lauflängenkodierungsschema, das Sequenzen identischer Pixelwerte zu Zähler-Wert-Paaren komprimiert und gute Komprimierungsverhältnisse für Bilder mit großen gleichfarbigen Flächen erzielt — typisch für computergenerierte Grafiken und gerenderte Szenen, wie sie in der informatischen Forschung jener Zeit üblich waren. Utah RLE unterstützt 1 bis 255 Farbkanäle pro Pixel bei 8 Bit pro Kanal und enthält einen Header mit Bildabmessungen, Kanalanzahl, Hintergrundfarbe und einer optionalen Farbkarte. Das Format verarbeitet Alphakanal-Daten als zusätzlichen Kanal, und leere Scanlines (die der Hintergrundfarbe entsprechen) können für weitere Komprimierung vollständig weggelassen werden. Das Utah Raster Toolkit stellte eine Suite von Unix-Kommandozeilentools zur Manipulation von RLE-Bildern bereit — Operationen wie Compositing, Skalierung, Rotation, Farbmanipulation und Formatkonvertierung — und etablierte ein Software-Paradigma, das später von Netpbm und ImageMagick aufgegriffen wurde. Ein Vorteil ist die grundlegende Rolle des Formats in der Computergrafik: Das Utah Raster Toolkit und sein RLE-Format entstanden in derselben Forschungsumgebung, die das Phong-Shading-Modell, Gouraud-Shading und die Teekanne hervorbrachte — und ein Grossteil der frühen Computergrafik-Forschung wurde in diesem Format gespeichert. Das Format wird von ImageMagick, GIMP und verschiedenen Legacy-Grafikwerkzeugen unterstützt.
IPL (IPLab) ist ein wissenschaftliches Bildformat, das von Scanalytics (später von BD Biosciences übernommen) für ihre IPLab-Software zur wissenschaftlichen Bildanalyse entwickelt wurde, die erstmals um 1988 erschien. Das Format wurde konzipiert, um Mikroskopie- und wissenschaftliche Bildgebungsdaten mit der Präzision und den Metadaten zu speichern, die für quantitative Analysen in der biologischen und biomedizinischen Forschung benötigt werden. IPL-Dateien unterstützen mehrere Datentypen einschließlich 8-Bit- und 16-Bit-vorzeichenlose Ganzzahlen, 16-Bit-vorzeichenbehaftete Ganzzahlen und 32-Bit-Gleitkomma-Pixelwerte und können die weiten Dynamikbereiche aufnehmen, die von Fluoreszenzmikroskopen, CCD-Kameras und anderen wissenschaftlichen Bildgebungsinstrumenten erzeugt werden. Das Format verarbeitet mehrdimensionale Datensätze einschließlich Z-Stapel (Fokusserien durch eine Probe), Zeitraffersequenzen und Mehrkanal-Fluoreszenzakquisitionen, bei denen jeder Kanal die Emission eines anderen Fluoreszenzfarbstoffs erfasst. IPL-Dateien enthalten einen Header mit Bildabmessungen, Datentyp, Ebenenzahl, räumlicher Kalibrierung (Pixel-zu-Mikrometer-Umrechnung) und Akquisitionsmetadaten vom Mikroskopsystem. Ein Vorteil ist die quantitative Integrität: Im Gegensatz zu fotografischen Formaten, die Gammakorrektur, Komprimierung oder Farbraumtransformationen anwenden, bewahrt IPL die rohen linearen Intensitätswerte vom Detektor und stellt sicher, dass Messungen von Fluoreszenzintensität, optischer Dichte oder Partikelzählungen an den Bilddaten direkt den gemessenen physikalischen Grössen entsprechen. Die Rolle des Formats in der Mikroskopie-Gemeinschaft ist ein weiterer praktischer Aspekt: IPLab war in den 1990er und 2000er Jahren weit verbreitet in der Zellbiologie, Neurowissenschaft und Pathologie, und archivierte IPL-Datensätze aus veröffentlichten Forschungen behalten ihren wissenschaftlichen Wert. IPL-Dateien können von ImageJ/FIJI, Bio-Formats und ImageMagick gelesen werden.