Conversor de IPL para PGX
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Sobre os formatos
IPL (IPLab) é um formato de imagem científica desenvolvido pela Scanalytics (posteriormente adquirida pela BD Biosciences) para seu software de análise de imagem científica IPLab, lancado pela primeira vez por volta de 1988. O formato foi projetado para armazenar dados de microscopia é imagem científica com a precisão é metadados necessários para análise quantitativa em pesquisa biologica é biomedica. Os arquivos IPL suportam múltiplos tipos de dados incluindo inteiros sem sinal de 8 é 16 bits, inteiros com sinal de 16 bits é valores de pixel em ponto flutuante de 32 bits, acomodando às amplas faixas dinamicas produzidas por microscopios de fluorescencia, câmeras CCD é outros instrumentos de imagem científica. O formato lida com conjuntos de dados multidimensionais incluindo pilhas Z (séries focais através de um especime), sequências time-lapse é aquisicoes de fluorescencia multicanal onde cada canal captura emissao de uma sonda fluorescente diferente. Os arquivos IPL incluem um cabecalho com dimensões de imagem, tipo de dado, número de planos, calibracao espacial (conversão de pixels para micrometros) é metadados de aquisicao do sistema de microscopio. Uma vantagem é a integridade quantitativa: diferente de formatos fotográficos que aplicam correção gama, compressão ou transformacoes de espaço de cor, o IPL preserva os valores de intensidade linear brutos do detector, garantindo que medidas de intensidade de fluorescencia, densidade otica ou contagem de particulas realizadas nos dados da imagem correspondam diretamente às quantidades fisicas sendo medidas. O papel do formato na comunidade de microscopia é outra consideracao prática: o IPLab foi amplamente usado em laboratorios de biologia celular, neurociencia é patologia ao longo dos anos 1990 é 2000, e conjuntos de dados IPL arquivados de pesquisas publicadas permanecem cientificamente valiosos. Arquivos IPL podem ser lidos por ImageJ/FIJI, Bio-Formats é ImageMagick.
PGX é um formato de imagem rasterizada simples de componente único definido como parte do padrão JPEG 2000 (ISO/IEC 15444) para uso em testes de conformidade é verificacao de implementações de codec JPEG 2000. Introduzido por volta de 2000 junto com a própria especificação JPEG 2000, os arquivos PGX armazenam um único componente de imagem (um canal de cor ou plano em escala de cinza) com um cabecalho de texto seguido por dados de pixel brutos, fornecendo uma representação de referência inequivoca contra a qual às saídas de codificador é decodificador podem ser comparadas amostra por amostra. O cabecalho é uma única linha ASCII especificando endianness (ML para big-endian, LM para little-endian), sinalidade (+ para sem sinal, - para com sinal), profundidade de bit (1 a 32 bits), largura é altura. Os dados de pixel seguem como valores binarios brutos, cada um ocupando o número mínimo de bytes necessários para a profundidade de bit especificada, com um valor por pixel. Para imagens de múltiplos componentes (como RGB), cada componente é armazenado em um arquivo PGX separado. A simplicidade deliberada do formato — sem compressão, sem metadados, sem suporte multicanal — garante que não haja ambiguidades na interpretação que possam mascarar bugs de codec. Uma vantagem é a precisão de verificacao: a representação não comprimida é exatamente especificada do PGX permite comparação bit a bit da saída decodificada de JPEG 2000 contra imagens de referência, essencial para certificar que uma implementacao de codec está em conformidade com o padrão. O papel do formato na estrutura de testes de conformidade do JPEG 2000 significa que é implementado por todo codec JPEG 2000 serio (OpenJPEG, Kakadu, etc.) é usado na suite oficial de testes de conformidade ISO. Arquivos PGX também podem ser processados por ImageMagick é várias ferramentas de desenvolvimento JPEG 2000.