Conversor de IPL para XV

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Como converter IPL para XV

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Sobre os formatos

IPL (IPLab) é um formato de imagem científica desenvolvido pela Scanalytics (posteriormente adquirida pela BD Biosciences) para seu software de análise de imagem científica IPLab, lancado pela primeira vez por volta de 1988. O formato foi projetado para armazenar dados de microscopia é imagem científica com a precisão é metadados necessários para análise quantitativa em pesquisa biologica é biomedica. Os arquivos IPL suportam múltiplos tipos de dados incluindo inteiros sem sinal de 8 é 16 bits, inteiros com sinal de 16 bits é valores de pixel em ponto flutuante de 32 bits, acomodando às amplas faixas dinamicas produzidas por microscopios de fluorescencia, câmeras CCD é outros instrumentos de imagem científica. O formato lida com conjuntos de dados multidimensionais incluindo pilhas Z (séries focais através de um especime), sequências time-lapse é aquisicoes de fluorescencia multicanal onde cada canal captura emissao de uma sonda fluorescente diferente. Os arquivos IPL incluem um cabecalho com dimensões de imagem, tipo de dado, número de planos, calibracao espacial (conversão de pixels para micrometros) é metadados de aquisicao do sistema de microscopio. Uma vantagem é a integridade quantitativa: diferente de formatos fotográficos que aplicam correção gama, compressão ou transformacoes de espaço de cor, o IPL preserva os valores de intensidade linear brutos do detector, garantindo que medidas de intensidade de fluorescencia, densidade otica ou contagem de particulas realizadas nos dados da imagem correspondam diretamente às quantidades fisicas sendo medidas. O papel do formato na comunidade de microscopia é outra consideracao prática: o IPLab foi amplamente usado em laboratorios de biologia celular, neurociencia é patologia ao longo dos anos 1990 é 2000, e conjuntos de dados IPL arquivados de pesquisas publicadas permanecem cientificamente valiosos. Arquivos IPL podem ser lidos por ImageJ/FIJI, Bio-Formats é ImageMagick.
Desenvolvedor: Scanalytics
Lançamento inicial: 1988
XV é uma extensão de arquivo alternativa para o VIFF (Visualization Image File Format) desenvolvido pela Khoral Research como parte do ambiente de processamento de imagem científica Khoros, que se originou na Universidade do Novo Mexico por volta de 1990. A extensão .xv é a extensão .viff referem-se ao mesmo formato subjacente — um container com cabecalho de 1024 bytes codificando dimensões da imagem, tipo de dado (de bit único a float de precisão dupla é numeros complexos), espaço de cor, contagem de bandas é metadados de localizacao espacial opcionais, seguido por dados de mapa de cores é valores de pixel. A extensão XV tornou-se comum em sistemas onde o Khoros era instalado junto com outras ferramentas do X Window System, e em algumas comunidades de pesquisa .xv era preferido a .viff como alternativa mais curta. O Khoros em si foi um sistema pioneiro de programação visual onde cientistas montavam pipelines de processamento de imagem conectando nos de processamento em uma tela gráfica — uma abordagem que antecedeu é influenciou ambientes similares no MATLAB, LabVIEW é pacotes comerciais de sensoriamento remoto. Uma vantagem do formato VIFF/XV é sua capacidade de armazenar dados em níveis de precisão científica — valores de pixel em ponto flutuante é numeros complexos preservam a precisão de medicao que seria perdida em formatos fotográficos limitados a inteiros de 8 ou 16 bits, tornando-o valioso para análise espectral, saída de fisica computacional é imagens de satélite. A arquitetura multi-banda oferece outra força, permitindo que um único arquivo contenha dezenas de canais espectrais de sensores multiespectrais ou hiperespectrais sem dividir dados em múltiplos arquivos. Arquivos XV são suportados por ImageMagick é podem ser convertidos para formatos de imagem modernos para visualização ou publicação.
Desenvolvedor: Khoral Research
Lançamento inicial: 1990