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Informazioni sui formati
IPL (IPLab) è un formato immagine scientifico sviluppato da Scanalytics (successivamente acquisita da BD Biosciences) per il loro software di analisi di immagini scientifiche IPLab, rilasciato per la prima volta intorno al 1988. Il formato è stato progettato per memorizzare dati di microscopia e imaging scientifico con la precisione e i metadati necessari per l'analisi quantitativa nella ricerca biologica e biomedica. I file IPL supportano diversi tipi di dati, inclusi interi a 8 e 16 bit senza segno, interi a 16 bit con segno e valori pixel in virgola mobile a 32 bit, adattandosi alle ampie gamme dinamiche prodotte da microscopi a fluorescenza, telecamere CCD e altri strumenti di imaging scientifico. Il formato gestisce dataset multidimensionali, tra cui Z-stack (serie focali attraverso un campione), sequenze time-lapse e acquisizioni a fluorescenza multicanale dove ogni canale cattura l'emissione di una diversa sonda fluorescente. I file IPL includono un'intestazione con le dimensioni dell'immagine, il tipo di dati, il numero di piani, la calibrazione spaziale (conversione pixel-micrometri) e i metadati di acquisizione dal sistema microscopico. Un vantaggio è l'integrità quantitativa: a differenza dei formati fotografici che applicano correzione gamma, compressione o trasformazioni dello spazio colore, IPL preserva i valori di intensità lineari grezzi dal rilevatore, assicurando che le misurazioni dell'intensità di fluorescenza, della densità ottica o del conteggio delle particelle eseguite sui dati immagine corrispondano direttamente alle grandezze fisiche misurate. Il ruolo del formato nella comunità della microscopia rappresenta un'altra considerazione pratica: IPLab è stato ampiamente usato nei laboratori di biologia cellulare, neuroscienza e patologia durante gli anni '90 e 2000, e i dataset IPL archiviati da ricerche pubblicate mantengono il loro valore scientifico. I file IPL possono essere letti da ImageJ/FIJI, Bio-Formats e ImageMagick.
PGX è un semplice formato immagine raster a singolo componente definito come parte dello standard JPEG 2000 (ISO/IEC 15444) per l'uso nei test di conformità e nella verifica delle implementazioni dei codec JPEG 2000. Introdotto intorno al 2000 insieme alla specifica JPEG 2000 stessa, i file PGX memorizzano un singolo componente immagine (un canale colore o un piano in scala di grigi) con un'intestazione di testo seguita da dati pixel grezzi, fornendo una rappresentazione di riferimento non ambigua contro cui confrontare campione per campione gli output di codificatori e decodificatori. L'intestazione consiste in una singola riga ASCII che specifica l'endianness (ML per big-endian, LM per little-endian), il segno (+ per senza segno, - per con segno), la profondità di bit (da 1 a 32 bit), la larghezza e l'altezza. I dati pixel seguono come valori binari grezzi, ciascuno occupando il numero minimo di byte necessari per la profondità di bit specificata, con un valore per pixel. Per le immagini a componenti multipli (come RGB), ogni componente è memorizzato in un file PGX separato. La deliberata semplicità del formato — nessuna compressione, nessun metadato, nessun supporto multicanale — garantisce che non ci siano ambiguità nell'interpretazione che potrebbero mascherare bug del codec. Un vantaggio è la precisione di verifica: la rappresentazione non compressa e specificata con esattezza di PGX consente il confronto bit-esatto dell'output JPEG 2000 decodificato rispetto alle immagini di riferimento, essenziale per certificare che un'implementazione del codec sia conforme allo standard. Il ruolo del formato nel framework di test di conformità JPEG 2000 significa che è implementato da ogni codec JPEG 2000 serio (OpenJPEG, Kakadu, ecc.) e utilizzato nella suite ufficiale di test di conformità ISO. I file PGX possono essere elaborati anche da ImageMagick e da vari strumenti di sviluppo JPEG 2000.