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GVは、1991年にAT&T Labs Researchで開発が始まったDOTグラフ記述言語に関連付けられたファイル拡張子であり、Graphviz（Graph Visualization Software）スイートがグラフ、ネットワーク、階層関係の構造化ダイアグラムを定義しレンダリングするために使用します。GVファイルは、宣言的な構文を使用してグラフを記述するプレーンテキスト文書です。ノードに名前を付け、有向（digraph）または無向（graph）のリンクでエッジを接続し、属性で形状、色、フォント、ラベルテキスト、レイアウトヒントなどの視覚的プロパティを制御します。Graphvizのレイアウトエンジン — dot（階層型）、neato（スプリングモデル）、fdp（力指向）、circo（円形）、twopi（放射状）、sfdp（スケーラブル力指向）— はGVファイルを読み込み、SVG、PNG、PDF、PostScriptなどの形式でレンダリング出力を生成します。この言語はサブグラフ、クラスタ、データベーススキーマ用のレコード型ノード、HTMLライクなラベルフォーマット、および階層レイアウトでのノード配置を精密に制御するためのランク制約をサポートしています。利点の一つは、内容とレイアウトの分離です — グラフ構造は宣言的に指定され、レイアウトアルゴリズムがすべての配置を自動的に処理するため、視覚的なダイアグラムツールで必要な面倒な手動配置が不要になります。これにより、GVファイルはプログラム生成ダイアグラムに最適です。ビルドシステム、ドキュメント生成ツール、コード解析ツールがDOT構文を出力し、グラフィカルインターフェースなしでプロフェッショナル品質のダイアグラムを作成できます。Graphvizはオープンソースで、すべてのプラットフォームで利用可能であり、そのDOT言語はJupyterノートブック、Doxygen、多くのIDEプラグインを含む多数のツールでサポートされています。
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。