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JFIF（JPEG File Interchange Format）は、JPEG圧縮画像を格納するための標準ファイルフォーマット仕様で、1991年にC-Cube MicrosystemsのEric Hamiltonによってバージョン1.0として公開され、1992年にバージョン1.02に更新されました。JPEG規格（ISO/IEC 10918-1）は圧縮アルゴリズム — ピクセルデータをコンパクトなビットストリームに変換する離散コサイン変換、量子化、エントロピー符号化 — を定義していますが、ファイルフォーマットは規定していません。JFIFは、相互運用可能な表示に必要なメタデータをJPEGビットストリームにラップする最小限のコンテナを定義してこのギャップを埋めます。ピクセルアスペクト比、解像度単位（DPIまたはドット/cm）、色空間仕様（CCIR 601によるRGBからの変換を使用したYCbCr）、およびオプションの埋め込みサムネイルが含まれます。JFIFコンテナは、ASCII文字列「JFIF」とバージョン番号を含むファイル先頭のAPP0マーカーセグメントによって識別されます。存在するほぼすべてのJPEGファイルがJFIF仕様に準拠しています — 人々が「JPEGファイル」と言及するとき、拡張子が.jpgや.jpegであっても、ほぼ常にJFIFファイルを意味しています。JFIFの利点の一つは普遍性です。JFIFのシンプルさと早期の公開日（競合提案であるEXIFに先行）は、事実上すべてのソフトウェアおよびハードウェアプラットフォームがベースラインJPEGファイルフォーマットとして採用することを意味し、JPEGを世界で最も広く使用される画像フォーマットにした相互運用性を確立しました。仕様の意図的なミニマリズムもまた強みです — 正しい表示に必要な本質的なメタデータのみを定義し、追加のAPPマーカーを通じてアプリケーション固有の拡張の余地を残すことで、JFIFはEXIFカメラデータ、ICCカラープロファイル、XMPメタデータに対応できるほど拡張可能でありながら、後方互換性を損なうことはありませんでした。
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。