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フォーマットについて
PBM（Portable Bitmap）は、Netpbm画像フォーマットファミリーのモノクロ（白黒、1ビット）メンバーで、1988年にJef PoskanzerがUnixシステム向けのPbmplusツールキットの一部として作成しました。このフォーマットには2つのバリアントがあります。ASCII（マジックナンバーP1）では各ピクセルがテキスト文字 '0'（白）または '1'（黒）として空白区切りで表現され、バイナリ（マジックナンバーP4）ではピクセルが1バイトあたり8ピクセルにパックされてコンパクトに格納されます。両バリアントとも、マジックナンバー、画像の幅と高さ、およびオプションのコメントを指定するプレーンテキストヘッダーで始まります。PBMは可能な限りシンプルな画像フォーマットとして設計されました — 1980年代にさまざまなUnixシステムとアプリケーション間で増殖した多くの互換性のないラスターフォーマット間の変換ブリッジフォーマットです。Netpbmの哲学は、あらゆるソースフォーマットをPBM/PGM/PPMに中間ステップとして変換し、その後ターゲットフォーマットに変換することで、ポータブルフォーマットをユニバーサルな交換レイヤーとして使用することでした。利点の一つは極端なシンプルさです — ASCIIバリアントはテキストエディタで文字通り手入力でき、両バリアントとも外部ライブラリなしでどのプログラミング言語でも簡単にパースおよび生成できます。ユニバーサルな画像処理中間フォーマットとしての役割もまた強みです。数百のNetpbmコマンドラインツールがPBM入力を受け付け、Unixパイプを通じた複雑な画像操作パイプラインを可能にします。PBMは、コンピュータサイエンス教育、OCR前処理、そして極めてシンプルなモノクロ画像表現が必要なあらゆるコンテキストで引き続き使用されています。
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。