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フォーマットについて
DCMは、医療画像データの取り扱い、保存、送信、印刷のための包括的なフレームワークであるDICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）標準のファイル拡張子です。米国放射線学会（ACR）および米国電機工業会（NEMA）が共同開発し、1993年にDICOM 3.0として現在の形に到達して以来、継続的に更新されています。DCMファイルは単なる画像コンテナではなく、ピクセルデータとともに、患者（氏名、ID、生年月日）、検査（日付、紹介医、説明）、撮影シリーズ（モダリティ、部位、患者体位）、および個別画像（撮影パラメータ、ピクセル間隔、ウィンドウ/レベル設定）を記述するグループに整理された豊富な構造化メタデータタグを内包します。DICOMは、モノクロ（8、12、または16ビット）、RGBカラー、YBRカラースペース、シネループや体積スタック用のマルチフレームシーケンスなど、幅広いピクセルデータ型をサポートし、JPEG、JPEG 2000、JPEG-LS、またはRLE圧縮をオプションで使用できます。利点の一つは臨床的な相互運用性です — CT、MRI、X線、超音波、PET、マンモグラフィーなど、あらゆる最新の医療画像装置がDICOM出力を生成し、すべてのPACS（画像保存通信システム）がそれを取り込むため、DICOMは放射線医学の共通言語となっています。埋め込まれた臨床コンテキストもまた重要な強みです — 汎用画像フォーマットとは異なり、各DCMファイルは画像を診断環境で正しく表示、計測、解釈するために必要なメタデータを携えています。
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。