Conversor de PGM para IPL
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Sobre os formatos
PGM (Portable Graymap) é o membro em escala de cinza da família de formatos de imagem Netpbm, criado por Jef Poskanzer em 1988 como parte do toolkit Pbmplus para sistemas Unix. O PGM armazena imagens de intensidade de canal único onde cada pixel possui um valor de cinza de 0 (preto) até um máximo especificado pelo usuário (tipicamente 255 para 8 bits ou 65535 para 16 bits). O formato existe em ASCII (número magico P2), onde os valores de pixel são escritos como numeros decimais em texto separados por espacos em branco, e binário (número magico P5), onde os valores são armazenados como bytes brutos. Ambas às variantes comecam com um cabecalho especificando o número magico, largura, altura é valor máximo de cinza. O PGM foi projetado como intermediário em escala de cinza na filosofia de pipeline converter-processar-converter do Netpbm: imagens de origem de qualquer formato são convertidas para PGM, processadas usando a extensa biblioteca de ferramentas de linha de comando do Netpbm é depois convertidas para o formato alvo. Uma vantagem é a transparência do formato — a variante ASCII torna os dados da imagem diretamente legíveis por humanos é trivialmente processaveis por ferramentas de texto como awk é grep, inestimavel para depuração é educacao. A adoção pela comunidade científica é de visao computacional é outro ponto forte: a representação direta de canal único do PGM o torna um formato natural para algoritmos de análise de imagem, e muitos artigos acadêmicos é materiais de curso utilizam exemplos em PGM. O formato é suportado por ImageMagick, GIMP é inumeras bibliotecas de processamento de imagem.
IPL (IPLab) é um formato de imagem científica desenvolvido pela Scanalytics (posteriormente adquirida pela BD Biosciences) para seu software de análise de imagem científica IPLab, lancado pela primeira vez por volta de 1988. O formato foi projetado para armazenar dados de microscopia é imagem científica com a precisão é metadados necessários para análise quantitativa em pesquisa biologica é biomedica. Os arquivos IPL suportam múltiplos tipos de dados incluindo inteiros sem sinal de 8 é 16 bits, inteiros com sinal de 16 bits é valores de pixel em ponto flutuante de 32 bits, acomodando às amplas faixas dinamicas produzidas por microscopios de fluorescencia, câmeras CCD é outros instrumentos de imagem científica. O formato lida com conjuntos de dados multidimensionais incluindo pilhas Z (séries focais através de um especime), sequências time-lapse é aquisicoes de fluorescencia multicanal onde cada canal captura emissao de uma sonda fluorescente diferente. Os arquivos IPL incluem um cabecalho com dimensões de imagem, tipo de dado, número de planos, calibracao espacial (conversão de pixels para micrometros) é metadados de aquisicao do sistema de microscopio. Uma vantagem é a integridade quantitativa: diferente de formatos fotográficos que aplicam correção gama, compressão ou transformacoes de espaço de cor, o IPL preserva os valores de intensidade linear brutos do detector, garantindo que medidas de intensidade de fluorescencia, densidade otica ou contagem de particulas realizadas nos dados da imagem correspondam diretamente às quantidades fisicas sendo medidas. O papel do formato na comunidade de microscopia é outra consideracao prática: o IPLab foi amplamente usado em laboratorios de biologia celular, neurociencia é patologia ao longo dos anos 1990 é 2000, e conjuntos de dados IPL arquivados de pesquisas publicadas permanecem cientificamente valiosos. Arquivos IPL podem ser lidos por ImageJ/FIJI, Bio-Formats é ImageMagick.