Conversor VIPS a IPL
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Sobre los formatos
VIPS es el formato de archivo nativo de la biblioteca de procesamiento de imágenes libvips), originalmente desarrollada por John Cupitt y Kirk Martinez en la National Gallery de Londres durante el proyecto VASARI (1989-1993) para la digitalización y análisis de alta resolución de pinturas. El formato VIPS almacena imágenes grandes en una disposición simple mapeable en memoria: un encabezado qué contiene las dimensiones de la imagen, número de bandas (canales), tipo de datos (entero de 8/16/32 bits, float, double, complex), interpretación de color, resolución y metadatos de offset, seguido de los datos de píxeles sin procesar en formato entrelazado por banda. Está disposición directa permite qué el gestor de memoria virtual del sistema operativo mapee el archivo directamente en el espacio de direcciones, permitiendo a libvips procesar imágenes mucho más grandes qué la RAM disponible paginando porciones dentro y fuera según sea necesario — una técnica llamada evaluación bajo demanda. Los archivos VIPS admiten imágenes con cualquier número de bandas a cualquier tipo numérico compatible, acomodando todo desde fotografías RGB estándar hasta conjuntos de datos hiperespectrales con cientos de bandas. Una ventaja es el rendimiento con imágenes grandes: la arquitectura de libvips procesa imágenes en mosaicos pequeños evaluados bajo demanda, lo qué significa qué una imagen de 100.000 x 100.000 píxeles puede recortarse, redimensionarse, enfocarse y guardarse sin cargar la imagen completa en memoria — una capacidad qué convierte a VIPS en el motor detrás de servicios de procesamiento de imágenes qué manejan millones de imágenes web. La herencia científica del formato es otra fortaleza — el proyecto VASARI requería analizar pinturas a ultra alta resolución con imagen multiespectral, y el soporte del formato VIPS para conteos de bandas arbitrarios y precisión de punto flotante refleja estos orígenes de imagen computacional. Los archivos VIPS se utilizan principalmente con la biblioteca libvips (disponible para C, Python, Ruby y otros lenguajes) y pueden convertirse a otros formatos mediante las herramientas de línea de comandos vips o ImageMagick.
IPL (IPLab) es un formato de imagen científica desarrollado por Scanalytics (posteriormente adquirida por BD Biosciences) para su software de análisis de imágenes científicas IPLab, publicado por primera vez alrededor de 1988. El formato fue diseñado para almacenar datos de microscopía e imagen científica con la precisión y los metadatos necesarios para el análisis cuantitativo en investigación biológica y biomédica. Los archivos IPL admiten múltiples tipos de datos incluyendo enteros de 8 y 16 bits sin signo, enteros de 16 bits con signo y valores de píxeles de punto flotante de 32 bits, acomodando los amplios rangos dinámicos producidos por microscopios de fluorescencia, cámaras CCD y otros instrumentos de imagen científica. El formato maneja conjuntos de datos multidimensionales incluyendo pilas Z (series focales a través de una muestra), secuencias de time-lapse y adquisiciones de fluorescencia multicanal dónde cada canal captura la emisión de una sonda fluorescente diferente. Los archivos IPL incluyen un encabezado con dimensiones de imagen, tipo de datos, número de planos, calibración espacial (conversión de píxeles a micrómetros) y metadatos de adquisición del sistema de microscopio. Una ventaja es la integridad cuantitativa: a diferencia de los formatos fotográficos qué aplican corrección gamma, compresión o transformaciones de espacio de color, IPL preserva los valores de intensidad lineales sin procesar del detector, asegurando qué las mediciones de intensidad de fluorescencia, densidad óptica o recuento de partículas realizadas sobre los datos de imagen correspondan directamente a las cantidades físicas qué se miden. El papel del formato en la comunidad de microscopía es otra consideración práctica: IPLab fue ampliamente utilizado en laboratorios de biología celular, neurociencia y patología durante los años 90 y 2000, y los conjuntos de datos IPL archivados de investigaciones publicadas siguen siendo científicamente valiosos. Los archivos IPL pueden leerse con ImageJ/FIJI, Bio-Formats e ImageMagick.